Per comodità si distinguono due collezioni, quella dei molluschi marini e quella dei molluschi fluviali e terrestri. Entrambe le collezioni comprendono esemplari di provenienza e datazione eterogenee e constano di campioni conservati sia in liquido sia a secco.
Il nucleo storico della collezione è oggi scomparso.
Gli esemplari marini conservati a secco sono purtroppo in numero assai esiguo rispetto a quanto doveva essere nell’Ottocento.
I campioni marini in liquido, provengono in piccola parte da acquisizioni di fine Ottocento, ma la maggior parte sono più recenti, frutto di scambi avvenuti negli anni 1950-1960 con la Stazione Zoologica di Napoli, con l’Istituito di Oceanografia di Messina e da campagne di studio nello Stretto di Messina e nell’Adriatico.
La collezione di molluschi di acque dolci e terrestri, conservati a secco, è costituita da un totale di circa 42.600 esemplari.